İşleme Tesislerinde Hijyen olmazsa olmaz bir faktördür. 1997 yılında, Ozonun gıda işletmelerinde kullanımı (GRAS) genel olarak emniyetli kabul edilmiştir.FDA nın 2002 yılındaki raporundan sonrada Ozonlu dezenfeksiyon sistemleri hızla kabul görmüştür..Her türlü gıda ürünlerinin yıkanmasında; Et, balık, sebze meyve yıkanmasında kullanılır.Yüzey sanitasyonunda, Ekipman, teçhizat yıkanmasında, Gıda ürünlerinin depolandığı alanlarda, Gıda ürünlerinin taşınması esnasında, Bakteriyel yükün giderilmesi, istenmeyen koku giderimi, saklama ömrünün artırılması, görünüm kalitesinin iyileştirilmesi için kullanılabilir.